RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ADAMDEC1O15204 470 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 STK17BO94768 372 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PRKD3O94806 890 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 AGFG2O95081 481 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 MFN2O95140 757 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF682O95780 498 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CBX7O95931 251 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 IGKV3-11P04433 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ALPPP05187 535 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FABP3P05413 133 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 IL7RP16871 459 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 RHCEP18577 417 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 TCN2P20062 427 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 MAOAP21397 527 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 MMP11P24347 488 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ADH7P40394 386 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FOLR3P41439 243 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 KCNJ5P48544 419 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 EMDP50402 254 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 RPS6KA3P51812 740 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 EPS8Q12929 822 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 EFR3AQ14156 821 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 NCF4Q15080 339 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ATP6AP1Q15904 470 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SYT16Q17RD7 645 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 COX20Q5RI15 118 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 HSDL2Q6YN16 418 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ANKFN1Q8N957 763 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PMEPA1Q969W9 287 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 VMP1Q96GC9 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM19Q96HH6 336 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 VSTM2LQ96N03 204 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 RDH12Q96NR8 316 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 BTBD9Q96Q07 612 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CRB3Q9BUF7 120 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 Q9H521 79 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 RUBCNLQ9H714 662 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CBLCQ9ULV8 474 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 WDR45Q9Y484 360 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 AGAP5A6NIR3 686 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 H3BNX3 289 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PEX12O00623 359 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FMO6PO60774 539 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 H6PDO95479 791 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 IL33O95760 270 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 DLGAP3O95886 979 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 LGI1O95970 557 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CST1P01037 141 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 IFNW1P05000 195 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 BCHEP06276 602 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 FESP07332 822 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 NGFRP08138 427 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 THRBP10828 461 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 UQCRBP14927 111 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 HPGDP15428 266 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 NCK1P16333 377 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 RRM2P31350 389 aa6.49□□□□□ -1.37
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