RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440395.1

TRAF3IP2-AS1-204, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 439 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 POU1F1P28069 291 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 EPHA2P29317 976 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ALDH4A1P30038 563 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CTSKP43235 329 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GABRA4P48169 554 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GSSP48637 474 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 UCNP55089 124 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GFERP55789 205 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PIGFQ07326 219 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MGAT2Q10469 447 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ST3GAL3Q11203 375 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MAP4K2Q12851 820 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 COX10Q12887 443 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 SLC13A2Q13183 592 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 DUSP8Q13202 625 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ILKQ13418 452 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 DGCR6Q14129 220 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GRM7Q14831 915 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 TRAM2Q15035 370 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 SEC23BQ15437 767 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 HLA-BQ31612 363 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 DCST2Q5T1A1 773 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GPR107Q5VW38 600 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MLIPQ5VWP3 458 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 RRM2BQ7LG56 351 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 GPR151Q8TDV0 419 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 RORBQ92753 470 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MYDGFQ969H8 173 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MUL1Q969V5 352 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ISOC1Q96CN7 298 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PEX11GQ96HA9 241 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 DGAT2Q96PD7 388 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 SDF2Q99470 211 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MCHR1Q99705 422 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 POLE3Q9NRF9 147 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CLN6Q9NWW5 311 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 KLHL3Q9UH77 587 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 MKLN1Q9UL63 735 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PTPRBP23467 1997 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 SH3D21A4FU49 640 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 FITM1A5D6W6 292 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 TTC36A6NLP5 189 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 H3BN98 237 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 KLK10O43240 276 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 PCDHGA12O60330 932 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 FCMRO60667 390 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CBFA2T3O75081 653 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 NKX2-2O95096 273 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 OR5F1O95221 314 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CTSBP07858 339 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 HTR1AP08908 422 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 CT62P0C5K7 136 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms