RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 OR4L1Q8NH43 312 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 SHC3Q92529 594 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 RAB3CQ96E17 227 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 TTC25Q96NG3 672 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF285Q96NJ3 590 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 PRODH2Q9UF12 536 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 FANCD2Q9BXW9 1451 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 NHSL1Q5SYE7 1610 aa3.66□□□□□ -1.82
TRPS1-204ENST00000422939 K7ERI5 159 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CHADO15335 359 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 SNX4O95219 450 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 TXNDC12O95881 172 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 GSTA1P08263 222 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CD1EP15812 388 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 DPP4P27487 766 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 AXLP30530 894 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 SLC7A2P52569 658 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 RIPK1Q13546 671 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 SLC10A1Q14973 349 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 AGKQ53H12 422 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 TAF3Q5VWG9 929 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 FADS6Q8N9I5 356 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 MLKLQ8NB16 471 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM45BQ96B21 275 aa3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 FAM122AQ96E09 287 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 UTRNP46939 3433 aa3.64□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 A8MUI8 341 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 TBX19O60806 448 aa3.64□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 ATP6V1C1P21283 382 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 LHX3Q9UBR4 397 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 FCER2P06734 321 aa3.63□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 UCP1P25874 307 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 STX17P56962 302 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 HERVK_113P63132 956 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 ERVK-8P63133 956 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 SPIBQ01892 262 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CENPPQ6IPU0 288 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa3.63□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.63□□□□□ -1.83
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