RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACER1Q8TDN7 264 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SMPDL3AQ92484 453 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FGGYQ96C11 551 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C16orf58Q96GQ5 468 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C5orf30Q96GV9 206 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARHGDIGQ99819 225 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C17orf62Q9BQA9 187 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 APOL6Q9BWW8 343 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPZ1Q9BXG8 430 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLCB1Q9NQ66 1216 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TBC1D22BQ9NU19 505 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRGBPQ9NV56 204 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TXNDC16Q9P2K2 825 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNPEPQ9ULA0 475 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANGPT4Q9Y264 503 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR10H1Q9Y4A9 318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CARMIL3Q8ND23 1372 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM120BA0PK00 339 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 E5RGE8 158 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MLNRO43193 412 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HCRTR1O43613 425 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HCN1O60741 890 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC19A2O60779 497 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SUPT3HO75486 399 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AKR7A3O95154 331 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NUDT14O95848 222 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCNE2O96020 404 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PENKP01210 267 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV3-48P01763 117 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MMP10P09238 476 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WNT2P09544 360 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GZMAP12544 262 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ATF6P18850 670 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NTSP30990 170 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR1D4P47884 311 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAP1AP62834 184 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPL32P62910 135 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IL5RAQ01344 420 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM53BQ14153 422 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC17A1Q14916 467 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC9A3R2Q15599 337 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAPK11Q15759 364 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF141Q15928 474 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HAGHQ16775 308 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TTC27Q6P3X3 843 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WDR86Q86TI4 376 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C9orf40Q8IXQ3 194 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRSS58Q8IYP2 241 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PNKDQ8N490 385 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAT8LQ8N9F0 302 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ICA1LQ8NDH6 482 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 APPL2Q8NEU8 664 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LPGAT1Q92604 370 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PGAM5Q96HS1 289 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HCAR1Q9BXC0 346 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AGXT2Q9BYV1 514 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WWP1Q9H0M0 922 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MMP27Q9H306 513 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ALG9Q9H6U8 611 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC40A1Q9NP59 571 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MED4Q9NPJ6 270 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMOD3Q9NYL9 352 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNRD1Q9P1U0 126 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLAGL1Q9UM63 463 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NSG2Q9Y328 171 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LAMA4Q16363 1823 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM223A0PJW6 202 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AGAP14A8MT82 685 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C10orf142B7Z368 130 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 H0YL77 283 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC188H7C350 402 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSMA7O14818 248 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FCGR3BO75015 233 aa-0.91□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms