RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR2T27Q8NH04 317 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MYLIPQ8WY64 445 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 APOLD1Q96LR9 279 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SSX3Q99909 188 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MECRQ9BV79 373 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 F5H423 210 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GABARAPH6UMI1 98 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A5O76082 557 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CHRM2P08172 466 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 IFI6P09912 130 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CDK4P11802 303 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MAOBP27338 520 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 AHRP35869 848 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CD83Q01151 205 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 APOFQ13790 326 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MORN1Q5T089 497 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL6Q8N531 539 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD9Q8NBP5 474 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GAB3Q8WWW8 586 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FAM136AQ96C01 138 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SCLYQ96I15 445 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RIMS3Q9UJD0 308 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GPSM3Q9Y4H4 160 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MEIOCA2RUB1 952 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 H3BSA7 217 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DLX3O60479 287 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 EDNRBP24530 442 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 G0S2P27469 103 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SNCAP37840 140 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R39P59534 338 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 KCNAB2Q13303 367 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR4K14Q8NGD5 310 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TBATAQ96M53 351 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ATF6BQ99941 703 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 COMMD3Q9UBI1 195 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ACOD1A6NK06 481 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FANCGO15287 622 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 VIPP01282 170 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 IL5P05113 134 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PGCP20142 388 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZP3P21754 424 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PRPH2P23942 346 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 BNIP3Q12983 259 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR5D14Q8NGL3 314 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NUS1Q96E22 293 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SGTBQ96EQ0 304 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PTAFRP25105 342 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SFT2D3Q587I9 215 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FAM124AQ86V42 546 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GPX8Q8TED1 209 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DDIT4LQ96D03 193 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 WACQ9BTA9 647 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ADAP2Q9NPF8 381 aa4.65□□□□□ -1.66
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