RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 KCNJ11Q14654 390 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 SBK1Q52WX2 424 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 ARSKQ6UWY0 536 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 CNPY4Q8N129 248 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 UPRTQ96BW1 309 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 SDSLQ96GA7 329 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 KRT23Q9C075 422 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 ASB8Q9H765 288 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa3.47□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 ABCC4O15439 1325 aa3.46□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.46□□□□□ -1.85
CSN3-201ENST00000304954 CASKO14936 926 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 HDAC3O15379 428 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 STSP08842 583 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CCNA2P20248 432 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 PSMA2P25787 234 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 KIF5BP33176 963 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 RGS19P49795 217 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 RIPPLY3P57055 190 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 FUT7Q11130 342 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SPP2Q13103 211 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 DPYSQ14117 519 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 TFDP1Q14186 410 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CDKN3Q16667 212 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CENPUQ71F23 418 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 TM2D1Q9BX74 207 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 EHD1Q9H4M9 534 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 NGBQ9NPG2 151 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 RDH8Q9NYR8 311 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CELA1Q9UNI1 258 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 MOKQ9UQ07 419 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.46□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 B4DXG7 233 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 OR7A17O14581 309 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 VPS26AO75436 327 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 STX11O75558 287 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB25P24278 435 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 EFNA3P52797 238 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 MTTPP55157 894 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 GPR65Q8IYL9 337 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 OR2L5Q8NG80 312 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 FGGYQ96C11 551 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 VPS35Q96QK1 796 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ZNF702PQ9H963 129 aa3.45□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ATRXP46100 2492 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 TBL1XO60907 577 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CLUP10909 449 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 PDHBP11177 359 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CHRNA3P32297 505 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 NTHL1P78549 312 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SCGB2A2Q13296 93 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ZNF79Q15937 498 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 CBWD2Q8IUF1 395 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SMIM14Q96QK8 99 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 GPA33Q99795 319 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 ECT2Q9H8V3 914 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 PDFQ9HBH1 243 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.44□□□□□ -1.86
CSN3-201ENST00000304954 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms