RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS5O15539 181 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1AP01583 271 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC6Q6NXE6 501 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 XKRXQ6PP77 449 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM129CQ86XR2 697 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 GDPD1Q8N9F7 314 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SRRQ9GZT4 340 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C2Q9NZP2 312 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX7Q9UNH6 387 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM25AB3EWG3 89 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM25CB3EWG5 89 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM25GB3EWG6 89 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 BRINP1O60477 761 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3DO95025 777 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MFN2O95140 757 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B7P16662 529 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX5P17844 614 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBB2P43320 205 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM11AP58511 58 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 OCLNQ16625 522 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 REEP3Q6NUK4 255 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LAS2Q8IYD9 372 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 GRPEL2Q8TAA5 225 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CMKLR1Q99788 373 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NDEL1Q9GZM8 345 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 APMAPQ9HDC9 416 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R16Q9NYV7 291 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS20P59510 1910 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ISM1B1AKI9 464 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 IL7P13232 177 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ST6GAL1P15907 406 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX2P48378 723 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf73Q69YU5 71 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71E1Q6IPT2 247 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOGP1Q8N7R0 232 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K1Q8NGD4 311 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8J1Q8NGP2 316 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF480Q8WV37 535 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM63Q969Q1 353 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPV9 198 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB7A8K855 629 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 J3KTA2 159 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FAAHO00519 579 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ENTPD6O75354 484 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF15O95150 251 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 POU2F1P14859 743 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRC2P22695 453 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPA1P29218 277 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 RTP5Q14D33 572 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A30Q5SVS4 291 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP12Q6UXS9 341 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 HSDL2Q6YN16 418 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD6Q7Z4G1 85 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 AGBL5Q8NDL9 886 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 BARHL1Q9BZE3 327 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIOCA2RUB1 952 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf74A8MZ97 194 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE9AO76083 593 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DSTNP60981 165 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS42Q7Z5A4 293 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 BMPERQ8N8U9 685 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR151Q8TDV0 419 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf78Q8WTQ4 265 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS1Q96LJ7 313 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC46A1Q96NT5 459 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA5BQ9P283 1151 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 REV1Q9UBZ9 1251 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TLCD2A6NGC4 264 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 YES1P07947 543 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 JMJD7P0C870 316 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf80Q0P641 193 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ZIC1Q15915 447 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC34A3Q8N130 599 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A46Q96AG3 418 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MED18Q9BUE0 208 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRB8 838 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC182A6NF36 153 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 HCRTR1O43613 425 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD34CP0C6C1 535 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ERGP11308 486 aa24.53■■□□□ 1.52
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