RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 CLN6Q9NWW5 311 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR83Q9NYM4 423 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 SELENONQ9NZV5 590 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PRAMEF2O60811 474 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 IGKV1D-16P01601 117 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GUSBP08236 651 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PRG2P13727 222 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ALAS2P22557 587 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 OR1D4P47884 311 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 FUT7Q11130 342 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF18BQ86Y91 864 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMA1P25391 3075 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PPW3 197 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 IFNA16P05015 189 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GKN3PP0CG01 181 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 HTR2AP28223 471 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GALNSP34059 522 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 OMPP47874 163 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PGDP52209 483 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 SERTAD2Q14140 314 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CASP12Q6UXS9 341 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PIGXQ8TBF5 258 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 MVB12AQ96EY5 273 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 NUDT22Q9BRQ3 303 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1B0GTQ1 180 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 STSP08842 583 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 RFX3P48380 749 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PLAURQ03405 335 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPAN31Q12999 210 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 MED25Q71SY5 747 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 KMT5CQ86Y97 462 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GAB3Q8WWW8 586 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 OR10A5Q9H207 317 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ENPP5Q9UJA9 477 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ENTPD6O75354 484 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CLPSP04118 112 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 LCKP06239 509 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CCNA2P20248 432 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PSMB9P28065 219 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GIPRP48546 466 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CDK5Q00535 292 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 BIKQ13323 160 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GINS1Q14691 196 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PLK5Q496M5 336 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 RRM2BQ7LG56 351 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 RCBTB1Q8NDN9 531 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 C16orf52Q8NHV5 167 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 YIPF6Q96EC8 236 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC25A19Q9HC21 320 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CNIH4Q9P003 139 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 MSL3P1P0C860 447 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CT45A8P0DMV1 189 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CT45A9P0DMV2 189 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 ST3GAL4Q11206 333 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 OR1Q1Q15612 314 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-201ENST00000216840 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms