RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ELP4Q96EB1 424 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RADILQ96JH8 1075 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM11O75078 769 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BEX3Q00994 111 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PKDCCQ504Y2 493 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 REC114Q7Z4M0 266 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ARMC5Q96C12 935 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3C2AO00443 1686 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A5O15375 505 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LYRM1O43325 122 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TK1P04183 234 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SNCAP37840 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PIGVQ9NUD9 493 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KDELR3O43731 214 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RETP07949 1114 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FAM163BP0C2L3 166 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ITGAMP11215 1152 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GABRR2P28476 465 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-25P63136 954 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PSD2Q9BQI7 771 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CLIC3O95833 236 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GAAP10253 952 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EDNRBP24530 442 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RAB13P51153 203 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 IL36AQ9UHA7 158 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GVT2 93 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R2P9O14990 202 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OPN1SWP03999 348 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ALPIP09923 528 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ETV5P41161 510 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEB1P43366 347 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PCBD1P61457 104 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ELP2Q6IA86 826 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DESI1Q6ICB0 168 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CD200R1Q8TD46 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 COPS9Q8WXC6 57 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HERVK_113Q902F9 699 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TSGA13Q96PP4 275 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MROH6A6NGR9 719 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 JRKO75564 520 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf47O95873 294 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT2Q10471 571 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PIM3Q86V86 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LRFN5Q96NI6 719 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CD8B2A6NJW9 211 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CCL22O00626 93 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 AHSGP02765 367 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CD8BP10966 210 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LINGO4Q6UY18 593 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT10Q86SR1 603 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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