RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 CREB1P16220 341 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 HK1P19367 917 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 CHMP24386 653 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 LHX2P50458 406 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 PDE7AQ13946 482 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 OR2M3Q8NG83 312 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 FBXO30Q8TB52 745 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 MTERF3Q96E29 417 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 MS4A4EQ96PG1 132 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 SH3GL2Q99962 352 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 DOCK7Q96N67 2140 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 ZIC3O60481 467 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 UTS2O95399 124 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 BPGMP07738 259 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 P4HA3Q7Z4N8 544 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 MARCH3Q86UD3 253 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 FADS6Q8N9I5 356 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 JADE3Q92613 823 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 C1orf50Q9BV19 199 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 EMC8O43402 210 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 GMFGO60234 142 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF708P17019 499 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 PRR5P85299 388 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 ZFP3Q96NJ6 502 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 CRIM1Q9NZV1 1036 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCH-216ENST00000555542 B4DXG7 233 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 TYROBPO43914 113 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 HSPA4LO95757 839 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 IL18BPO95998 194 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PEPDP12955 493 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CLDN18P56856 261 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 XKR7Q5GH72 579 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GALNT10Q86SR1 603 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 KIF18BQ86Y91 864 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 MREGQ8N565 214 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 MEIOBQ8N635 442 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 WNT2BQ93097 391 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SFXN3Q9BWM7 321 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CENPHQ9H3R5 247 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PDZD2O15018 2839 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 WDR91A4D1P6 747 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 NKX2-2O95096 273 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 RCBTB2O95199 551 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ANGPTL1O95841 491 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ALOX5P09917 674 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CPA2P48052 419 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PRIM2P49643 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FOXF2Q12947 444 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FLYWCH1Q4VC44 716 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FIGNL1Q6PIW4 674 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GCNT2Q8N0V5 402 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 C3orf30Q96M34 536 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CLCF1Q9UBD9 225 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1W2PRB8 838 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 H3BML4 177 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SEC14L5O43304 696 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 IGKV1D-16P01601 117 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ACP2P11117 423 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 HPGDP15428 266 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ARRB2P32121 409 aa22.12■■□□□ 1.13
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