RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 LAMP1P11279 417 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CLDN20P56880 219 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GAB1Q13480 694 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PDK3Q15120 406 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 RASA2Q15283 850 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 RPS6KA2Q15349 733 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 EMC4Q5J8M3 183 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GHDCQ8N2G8 530 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 KDM8Q8N371 416 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 NPHS2Q9NP85 383 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PNR3 127 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ACOT7O00154 380 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 FRS3O43559 492 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 HCRTR2O43614 444 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CEACAM4O75871 244 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 KLK2P20151 261 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 FUT4P22083 530 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 HLCSP50747 726 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ARFIP2P53365 341 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ZNF385BQ569K4 471 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GK5Q6ZS86 529 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 RND1Q92730 232 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ZG16BQ96DA0 208 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 OR1F2PQ96R84 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 MMP25Q9NPA2 562 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PSME2Q9UL46 239 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CLOCKO15516 846 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PLIN3O60664 434 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TGDSO95455 350 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 IGHEP01854 428 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TFAP2AP05549 437 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 NRG3P56975 720 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 NUP107P57740 925 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 LIPMQ5VYY2 423 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ATG16L1Q676U5 607 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CARFQ8N187 725 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GPR119Q8TDV5 335 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 UBE2E3Q969T4 207 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 AHSPQ9NZD4 102 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 MED12LQ86YW9 2145 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 G3V2L1 256 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 MAGEB3O15480 346 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 BAG2O95816 211 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 C6orf47O95873 294 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CLPTM1O96005 669 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TFPIP10646 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 IL11P20809 199 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 SLC37A1P57057 533 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 RELAQ04206 551 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 LCP2Q13094 533 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 CBLN3Q6UW01 205 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 TREML1Q86YW5 311 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-212ENST00000548567 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.88□□□□□ -1.31
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