RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545250.5

TSC1-208, Transcript of TSC complex subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSC1, Length 8,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1-208ENST00000545250 A0A1W2PPM1 405 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 SOBPA7XYQ1 873 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 KIAA0355O15063 1070 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 SLITRK3O94933 977 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PRSS3P35030 304 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 HK3P52790 923 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 UBE2KP61086 200 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 GNB2P62879 340 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 SERTAD2Q14140 314 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 GRM7Q14831 915 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 MICAQ29983 383 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 Q6ZRG5 221 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TMEM104Q8NE00 496 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 IER2Q9BTL4 223 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 NMES1Q9C002 83 aa8.7□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PNPP00491 289 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TGM1P22735 817 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 COMMD7Q86VX2 200 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 KDM1BQ8NB78 822 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 NUP43Q8NFH3 380 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 REEP6Q96HR9 211 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 OR5B2Q96R09 309 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PSD2Q9BQI7 771 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 DOHHQ9BU89 302 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 GOSR1O95249 250 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 ITGB2P05107 769 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 IGKV5-2P06315 115 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 IMPA1P29218 277 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 RAB33AQ14088 237 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 NFATC4Q14934 902 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 DPM1O60762 260 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 SLC14A1Q13336 389 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 VGLL4Q14135 290 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 RNLSQ5VYX0 342 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.69□□□□□ -1.02
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TSC1-208ENST00000545250 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.69□□□□□ -1.02
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TSC1-208ENST00000545250 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 PLSCR1O15162 318 aa8.69□□□□□ -1.02
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TSC1-208ENST00000545250 CDK4P11802 303 aa8.69□□□□□ -1.02
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TSC1-208ENST00000545250 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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TSC1-208ENST00000545250 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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TSC1-208ENST00000545250 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 GNG12Q9UBI6 72 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 ZNF732B4DXR9 585 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 TUSC2O75896 110 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 AKAIN1P0CW23 69 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 CSNK1A1P48729 337 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.69□□□□□ -1.02
TSC1-208ENST00000545250 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.69□□□□□ -1.02
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