RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	HAS3	O00219	553 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SLC1A7	O00341	560 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RGS14	O43566	566 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	STX11	O75558	287 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	CABYR	O75952	493 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	OR2F2	O95006	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	NXPH2	O95156	264 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	LRAT	O95237	230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	CST1	P01037	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ACADS	P16219	412 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	IMPDH1	P20839	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	PCMT1	P22061	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RRM2	P31350	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	CDH11	P55287	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	PLP1	P60201	277 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	PAX5	Q02548	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	KLRC3	Q07444	240 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TRAF1	Q13077	416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MICB	Q29980	383 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ART5	Q96L15	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456		A0A087WZ39	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456		A0A1B0GUH1	482 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TAPBP	O15533	448 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MLNR	O43193	412 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF254	O75437	659 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TOX	O94900	526 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MB	P02144	154 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	HMOX2	P30519	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RORA	P35398	523 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	BCAP31	P51572	246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ACLY	P53396	1101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TPM4	P67936	248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	BDH1	Q02338	343 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	NUS1	Q96E22	293 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PRR4-209	ENST00000541456	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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