RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 STX11O75558 287 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 ADRB1P08588 477 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 GSTM3P21266 225 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 20.9
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SH3BP2-209ENST00000504450 TCTE1Q5JU00 501 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A30Q5SVS4 291 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 DCST2Q5T1A1 773 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A45Q8N413 288 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC12Q96GR4 267 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 TGM7Q96PF1 710 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP2-209ENST00000504450 MCHR1Q99705 422 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 BNIP3Q12983 259 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPAN31Q12999 210 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 CSRP2Q16527 193 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 EIPR1Q53HC9 387 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 NKAIN2Q5VXU1 208 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-209ENST00000504450 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.02□□□□□ -0.81
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