RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880		H0Y3Z8	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	UTS2	O95399	124 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PSMG1	O95456	288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ACP2	P11117	423 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HPGD	P15428	266 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	BMP7	P18075	431 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	LBP	P18428	481 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DPP4	P27487	766 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DIO3	P55073	304 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	WNT3	P56703	355 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MED11	Q9P086	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN8	P56748	225 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RCAN2	Q14206	197 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25	5e-8	■■■□□ 18.1
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP5	Q16690	384 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DCST1	Q5T197	706 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CDS1	Q92903	461 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FBN2	P35556	2912 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	LRBA	P50851	2863 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	APC	P25054	2843 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NKX2-2	O95096	273 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ANGPTL1	O95841	491 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ACTL6A	O96019	429 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	IFI6	P09912	130 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	HK1	P19367	917 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SRD5A2	P31213	254 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	PTGER4	P35408	488 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	STAR	P49675	285 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MLC1	Q15049	377 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	VASN	Q6EMK4	673 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	COQ8B	Q96D53	544 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GIMAP5	Q96F15	307 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880		Q9UFV3	132 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SSR4-208	ENST00000471880	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.45	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms