RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PPL8 197 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FEZF1A0PJY2 475 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PPM1DO15297 605 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF13O43567 381 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PEX14O75381 377 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RGS11O94810 467 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 HPXP02790 462 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FCER2P06734 321 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CTSAP10619 480 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ACSL1P33121 698 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 THBS2P35442 1172 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZP1P60852 638 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB14P61106 215 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA9Q16795 377 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 HBMQ6B0K9 141 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 AMER3Q8N944 861 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ACOT12Q8WYK0 555 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR6C2Q9NZP2 312 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 P2RX2Q9UBL9 471 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SPATA2Q9UM82 520 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ICKQ9UPZ9 632 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 E9PI62 339 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PIP5K1CO60331 668 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PPM1BO75688 479 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RB1P06400 928 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD34CP0C6C1 535 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 AHRP35869 848 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC3A1Q07837 685 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ARSKQ6UWY0 536 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS45Q7RTY3 260 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OAFQ86UD1 273 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SORCS1Q8WY21 1168 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TM4SF18Q96CE8 201 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZG16BQ96DA0 208 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RADILQ96JH8 1075 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC35G5Q96KT7 338 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PRRC1Q96M27 445 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GSX2Q9BZM3 304 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CBLCQ9ULV8 474 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 NUMA1Q14980 2115 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 M0R233 179 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TOR1AO14656 332 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SOX30O94993 753 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ACSM4P0C7M7 580 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RFX3P48380 749 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ACSM1Q08AH1 577 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GSG1Q2KHT4 349 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 AADACL4Q5VUY2 407 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RPTNQ6XPR3 784 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CPOQ8IVL8 374 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM99Q8N816 258 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4D9Q8NGE8 314 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CAPNS2Q96L46 248 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 DDOQ99489 341 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LRFN2Q9ULH4 789 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LIPT1Q9Y234 373 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNE3Q9Y6H6 103 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GVI7 797 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CHST10O43529 356 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TMPRSS11DO60235 418 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FZD7O75084 574 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms