RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 IFNEQ86WN2 208 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 RIMKLAQ8IXN7 391 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 FADS6Q8N9I5 356 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 NAXEQ8NCW5 288 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TNIP2Q8NFZ5 429 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO30Q8TB52 745 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 GPR151Q8TDV0 419 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ZIC3O60481 467 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 KCNH1O95259 989 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 MYZAPP0CAP1 466 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ACP2P11117 423 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 CPN1P15169 458 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 GCKP35557 465 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SLC1A6P48664 564 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 OR4K17Q8NGC6 315 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SLC9A6Q92581 669 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DKKL1Q9UK85 242 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PRB8 838 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 HSPB2A8KAH6 182 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 UTS2O95399 124 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 G6PDP11413 515 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PRPS1L1P21108 318 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DPP4P27487 766 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TIMP3P35625 211 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 EMX2Q04743 252 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 STX5Q13190 355 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 HSPB2Q16082 182 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 OR2M3Q8NG83 312 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 COQ8BQ96D53 544 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DSN1Q9H410 356 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ASIC5Q9NY37 505 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 HAO1Q9UJM8 370 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 CD8B2A6NJW9 211 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DUSP5Q16690 384 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SMU1Q2TAY7 513 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 GRAMD1BQ3KR37 738 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ENPP6Q6UWR7 440 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 MARCH3Q86UD3 253 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TRIB1Q96RU8 372 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 AKTIPQ9H8T0 292 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 STARP49675 285 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 LHX2P50458 406 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 C21orf58P58505 322 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 B3GALT5-AS1P59052 145 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PRR5P85299 388 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 STX3Q13277 289 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 APOOLQ6UXV4 268 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT10Q86SR1 603 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 FAM110BQ8TC76 370 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 ZPLD1Q8TCW7 415 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 OR5P2Q8WZ92 322 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SFXN2Q96NB2 322 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 YIPF4Q9BSR8 244 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 CALHM2Q9HA72 323 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SDHAF3Q9NRP4 125 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 MED11Q9P086 117 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 MPDZO75970 2070 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 KCNK2O95069 426 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 SSTR2P30874 369 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 DIO3P55073 304 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 BST1Q10588 318 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 AKAP6Q13023 2319 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 AAGABQ6PD74 315 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-202ENST00000460160 POMZP3Q6PJE2 187 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms