RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444502.5

TOP3B-210, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 4,163 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-210ENST00000444502 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 HCRTR2O43614 444 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 SEC14L2O76054 403 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 GPX2P18283 190 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 PCGF2P35227 344 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 GRK6P43250 576 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 MVKQ03426 396 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 GINS1Q14691 196 aa9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 KIAA0040Q15053 153 aa9.96□□□□□ -0.81
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TOP3B-210ENST00000444502 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.96□□□□□ -0.81
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TOP3B-210ENST00000444502 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
TOP3B-210ENST00000444502 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.96□□□□□ -0.81
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TOP3B-210ENST00000444502 CRISP1P54107 249 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 SYPL1Q16563 259 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.96□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.96□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MEIOCA2RUB1 952 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 CASKO14936 926 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MC3RP41968 323 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 XCR1P46094 333 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.96□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 FCGR1BQ92637 280 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.96□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 NUP50Q9UKX7 468 aa9.96□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.95□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 KCNJ13O60928 360 aa9.95□□□□□ -0.82
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TOP3B-210ENST00000444502 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 ITGA1P56199 1179 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 HOXC5Q00444 222 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 KIR2DS3Q14952 304 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 LCTLQ6UWM7 567 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 IFNGP01579 166 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 FURINP09958 794 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MYL9P24844 172 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 CXCR1P25024 350 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 YPEL5P62699 121 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF33BQ06732 778 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 SGCBQ16585 318 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 COMMD7Q86VX2 200 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 PRR22Q8IZ63 422 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 C10orf111Q8N326 155 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MCHR1Q99705 422 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 MYNNQ9NPC7 610 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TOP3B-210ENST00000444502 A0A0J9YY10 115 aa9.95□□□□□ -0.82
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