RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTT2P0CG29 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTT2BP0CG30 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GAP43P17677 238 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FUT1P19526 365 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RPA1P27694 616 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 EMDP50402 254 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 P2RY4P51582 365 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SPP2Q13103 211 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF79Q15937 498 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN3Q16667 212 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PAGE2BQ5JRK9 111 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LPCAT2Q7L5N7 544 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR22Q8IZ63 422 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CEND1Q8N111 149 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ELMO2Q96JJ3 720 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM111AQ96PZ2 611 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf24Q9BVV8 132 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF702PQ9H963 129 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCB10Q9NRK6 738 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 L3MBTL1Q9Y468 752 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT87PA6NCN2 255 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP92A6NM28 416 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RASGRF2O14827 1237 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 AZU1P20160 251 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNA2P20248 432 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZP3P21754 424 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 IL10P22301 178 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GPC3P51654 580 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 OVGP1Q12889 678 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNJ11Q14654 390 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CEBPEQ15744 281 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR4Q16378 134 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 IRGCQ6NXR0 463 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CADM2Q8N3J6 435 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 BPIFB2Q8N4F0 458 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CERS5Q8N5B7 392 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A38Q96DW6 304 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM122AQ96E09 287 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZIM3Q96PE6 472 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 COMMD4Q9H0A8 199 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GLT8D2Q9H1C3 349 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 YAE1D1Q9NRH1 226 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf123Q9NWV4 160 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM9Q9P0T7 183 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GMPPBQ9Y5P6 360 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 WASHC1A8K0Z3 465 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 WASH3PC4AMC7 463 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 E9PLD3 99 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 HDAC3O15379 428 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SERF1AO75920 110 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 APBB3O95704 486 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RRASP10301 218 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJB1P25685 340 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 NF2P35240 595 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ASMTP46597 345 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RIPPLY3P57055 190 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF154Q13106 437 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 DPYSQ14117 519 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 DPYSL3Q14195 570 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ADPRMQ3LIE5 342 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM52BQ4KMG9 183 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 SBK1Q52WX2 424 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM120AOSQ5T036 256 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF544Q6NX49 715 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 WASH2PQ6VEQ5 465 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CYS1Q717R9 158 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 BCORP1Q8N888 145 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 CNNM3Q8NE01 707 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-202ENST00000370826 GIPC3Q8TF64 312 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms