RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 HYAL4Q2M3T9 481 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GTDC1Q4AE62 458 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 COQ5Q5HYK3 327 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 CCNJQ5T5M9 372 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 BICRALQ6AI39 1079 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 OR52N2Q8NGI0 321 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RNF138Q8WVD3 245 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NR4A3Q92570 626 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM41AQ96HV5 264 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 HHATLQ9HCP6 504 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 SDHAF3Q9NRP4 125 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 UBQLN4Q9NRR5 601 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ARMCX1Q9P291 453 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 LIPT1Q9Y234 373 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GMEB1Q9Y692 573 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 HMGN4O00479 90 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FADS1O60427 444 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 STX11O75558 287 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NGFRP08138 427 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GUSBP08236 651 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 EVI2BP34910 448 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 PTGDSP41222 190 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 CRATP43155 626 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 MMEL1Q495T6 779 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 DLEU7Q6UYE1 221 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RAB8BQ92930 207 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF597Q96LX8 424 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC106Q9BWC9 280 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TTTY12Q9BZ98 90 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO34Q9NWN3 711 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 CORO2BQ9UQ03 480 aa24.5■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GTF3C1Q12789 2109 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 LOC100653049A0A140TA62 436 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 KRT34O76011 436 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GLSO94925 669 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 UNC5CO95185 931 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NPPAP01160 153 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TBXA2RP21731 343 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RFC3P40938 356 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 MASP1P48740 699 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 MVDP53602 400 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 PPIAP62937 165 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RGNQ15493 299 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 KRTCAP3Q53RY4 240 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 COX20Q5RI15 118 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GALNT10Q86SR1 603 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RETREG3Q86VR2 466 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 POLE3Q9NRF9 147 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 VAPAQ9P0L0 249 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 B4GALT7Q9UBV7 327 aa24.49■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NBASA2RRP1 2371 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 EVPLLA8MZ36 301 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FBP2O00757 339 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TFECO14948 347 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 C1QCP02747 245 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 HPGDP15428 266 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FADDQ13158 208 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NFYCQ13952 458 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RNFT1Q5M7Z0 435 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 SNX32Q86XE0 403 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 MSRB3Q8IXL7 192 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 OR4C3Q8NH37 302 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 MIB2Q96AX9 1013 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 GALNT9Q9HCQ5 603 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 WIF1Q9Y5W5 379 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC13O75165 2243 aa24.48■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF462Q96JM2 2506 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 RUNDC3AQ59EK9 446 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TIGD3Q6B0B8 471 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF527Q8NB42 609 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ROPN1LQ96C74 230 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 QPCTLQ9NXS2 382 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FLRT3Q9NZU0 649 aa24.47■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 NCKAP5O14513 1909 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms