RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 BMP4P12644 408 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 ACPPP15309 386 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 FBXO43Q4G163 708 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 NIPAL3Q6P499 406 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 STOMP27105 288 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 TM9SF3Q9HD45 589 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.21□□□□□ -0.61
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PP18 115 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 H7C2Y5 167 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MTHFD2P13995 350 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GLO1Q04760 184 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM19Q96HH6 336 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PQ09 198 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HLA-DPB1P04440 258 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TGM4P49221 684 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF675Q8TD23 568 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 B8ZZF3 427 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MPC1LP0DKB6 136 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CX3CR1P49238 355 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CAMK2DQ13557 499 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 EPGNQ6UW88 154 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF566Q969W8 418 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.21□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LPLP06858 475 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MSR1P21757 451 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 PARM1Q6UWI2 310 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GID4Q8IVV7 300 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ESX1Q8N693 406 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HMX3A6NHT5 357 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 A6NIN4 97 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF695Q8IW36 515 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5AS1Q8N127 324 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LRR1Q96L50 414 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TEPSINQ96N21 525 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NELL2Q99435 816 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CUTCQ9NTM9 273 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GRPP07492 148 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GJA4P35212 333 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CLDN17P56750 224 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM57BQ71RH2 274 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTRT3Q9BYD9 372 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CD93Q9NPY3 652 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 H7C1C5 153 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RBBP9O75884 186 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 S1PR4O95977 384 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SERPINA5P05154 406 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RAD52P43351 418 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LCN6P62502 163 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SCGB2A2Q13296 93 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB11BQ15907 218 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 VASNQ6EMK4 673 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TDHQ8IZJ6 230 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 FNIP2Q9P278 1114 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF6Q9Y252 685 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DDCP20711 480 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NFYBP25208 207 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 PTH2RP49190 550 aa11.2□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 P2RY14Q15391 338 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms