RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DNHD1Q96M86 4753 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.59□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBC2A0A5B9 178 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IRGMA1A4Y4 181 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ISPDA4D126 451 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2A25A4D2G3 310 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NCN8 305 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCA1A8K7I4 914 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 E9PQ18 207 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TOR1BO14657 336 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3BGRLO75368 114 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DIRAS1O95057 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ETHE1O95571 254 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DLGAP3O95886 979 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAP00813 363 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK1P06493 297 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IL3P08700 152 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ETFAP13804 333 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CD36P16671 472 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF28P17035 718 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DDCP20711 480 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH3P22223 829 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CD40LGP29965 261 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NTSP30990 170 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNA8P32881 189 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A5P33763 92 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX6P35712 828 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGA2P52926 109 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ARFIP1P53367 373 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH12P55289 794 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HBA1P69905 142 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 REEP5Q00765 189 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TGM3Q08188 693 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GAB1Q13480 694 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SPCS2Q15005 226 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CTF1Q16619 201 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFA9Q16795 377 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT13Q86X67 352 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF130Q86XS8 419 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC34A3Q8N130 599 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC15A4Q8N697 577 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8NA96 180 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 COX14Q96I36 57 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FEVQ99581 238 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51B5Q9H339 312 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RMI1Q9H9A7 625 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF6Q9Y252 685 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SNTNA6NMZ2 147 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FAAHO00519 579 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PPM1DO15297 605 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AIREO43918 545 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC3AO75596 197 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SULT1C4O75897 302 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GALT4O96024 378 aa6.57□□□□□ -1.36
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