RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 CLMPQ9H6B4 373 aa21.86■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 HCSTQ9UBK5 93 aa21.86■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ERVFC1P60507 584 aa21.86■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 TAS2R8Q9NYW2 309 aa21.86■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 E2F3O00716 465 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 FBP2O00757 339 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 MELKQ14680 651 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 RPE65Q16518 533 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 SSX6Q7RTT6 188 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 KLHL15Q96M94 604 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 M0R3H8 397 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 MAP2K3P46734 347 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 FXYD6P3P58550 94 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM53Q6P2H8 277 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 FOXRED2Q8IWF2 684 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 Q8N402 240 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 SAMD8Q96LT4 415 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 FN3KQ9H479 309 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 DCST2Q5T1A1 773 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 CASTOR1Q8WTX7 329 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 HDAC8Q9BY41 377 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 GPR83Q9NYM4 423 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZXDBP98169 803 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PIGFQ07326 219 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 OR8S1Q8NH09 359 aa21.85■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PCDH17O14917 1159 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 GPR75O95800 540 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ART1P52961 327 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 RAB11BQ15907 218 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF534Q76KX8 674 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 LIX1LQ8IVB5 337 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 UBXN10Q96LJ8 280 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 SFXN2Q96NB2 322 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF700Q9H0M5 742 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 BTAF1O14981 1849 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 FAM227AF5H4B4 570 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF806P0C7X5 589 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 RAB3BP20337 219 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 TCTN2Q96GX1 697 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC120Q96HB5 630 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 SLC6A5Q9Y345 797 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 A6NLC8 198 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 DIRAS3O95661 229 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 LAS2Q8IYD9 372 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 MFSD9Q8NBP5 474 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 UBTD2Q8WUN7 234 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 SPTSSAQ969W0 71 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 ERVK-19Q9WJR5 959 aa21.84■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 CD8B2A6NJW9 211 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 CD8BP10966 210 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 MS4A2Q01362 244 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 H0YIV9 168 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 PPP1R3DO95685 299 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 DEFA5Q01523 94 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.83■■□□□ 1.09
TARBP1-201ENST00000040877 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 FUT1P19526 365 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 GAREM2Q75VX8 874 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 METTL4Q8N3J2 472 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 OR5AK2Q8NH90 309 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 MRI1Q9BV20 369 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 BTBD2Q9BX70 525 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 DPH1Q9BZG8 443 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 VNN2O95498 520 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 PHC2Q8IXK0 858 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 TM9SF4Q92544 642 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 POU2F3Q9UKI9 436 aa21.83■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 GGT3PA6NGU5 568 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 DNAJB6O75190 326 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 GSKIPQ9P0R6 139 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 NUP50Q9UKX7 468 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 MYO9BQ13459 2157 aa21.82■■□□□ 1.08
TARBP1-201ENST00000040877 CPMP14384 443 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms