RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csn1s2aQ02862 184 aa8.66□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 InhaQ04997 366 aa8.66□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10696Q3UTC4 357 aa8.66□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grip1Q925T6 1127 aa8.66□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r77E9PY60 306 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm17067E9Q6S4 354 aa8.65□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf148G3X9R7 316 aa8.65□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FstP47931 344 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gadd45aP48316 165 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tm9sf2P58021 662 aa8.65□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnk6Q3TBV4 313 aa8.65□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RflnbQ5SVD0 216 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mc2rQ64326 296 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grm7Q68ED2 915 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Szrd1Q6NXN1 152 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olig3Q6PFG8 273 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ffar1Q76JU9 300 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r140Q7TQA4 312 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr728Q7TRM6 311 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AasdhQ80WC9 1100 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf787Q8BIF9 381 aa8.65□□□□□ -1.02
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Edem2Q8BJT9 577 aa8.65□□□□□ -1.02
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Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptpn7Q8BUM3 359 aa8.65□□□□□ -1.02
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