RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TagapB2RWW0 714 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Amd2D3Z6H8 334 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 KeraO35367 351 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc6a2O55192 617 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Amd1P0DMN7 334 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcsk2P21661 637 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 VldlrP98156 873 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Defb41Q30KP6 65 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Thoc6Q5U4D9 341 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr140Q60878 302 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chst2Q80WV3 530 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Palm2Q8BR92 376 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lpcat2Q8BYI6 544 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc38a4Q8R1S9 547 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcolce2Q8R4W6 414 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptgr2Q8VDQ1 351 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tnfaip8Q921Z5 198 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BollQ924M5 281 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vkorc1Q9CRC0 161 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 9030624G23RikQ9D308 155 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q9D3J9 298 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcb9Q9JJ59 762 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr49Q9Z1V0 313 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccl27Q9Z1X0 120 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpr179E9PY61 2293 aa17■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 S100zB9EJL3 99 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 A530032D15RikE9Q422 215 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm2056J3QQ02 144 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gsta2P10648 222 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdh2P15116 906 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 FesP16879 822 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GlaP51569 419 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sem1P60897 70 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Otub1Q7TQI3 271 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cldn34b3Q80ZS5 209 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fgd2Q8BY35 655 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 HscbQ8K3A0 234 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CthQ8VCN5 398 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ogfrl1Q8VE52 464 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr583Q8VG25 319 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Siglec5Q920G3 569 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chrm5Q920H4 532 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Psat1Q99K85 370 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acss1Q99NB1 682 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NarfQ9CYQ7 462 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Maf1Q9D0U6 258 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mrpl19Q9D338 292 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Jag2Q9QYE5 1247 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtgfrnQ9WV91 879 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Upk1bQ9Z2C6 260 aa16.99■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc25a34A2ADF7 318 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn1r175K7N6T9 304 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm6337K7N6X9 211 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm3115L7N285 211 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nfkbil1O88995 381 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nudt2P56380 147 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr20Q3UWE6 569 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tnfaip3Q60769 775 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PgghgQ8BP56 690 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hs3st5Q8BSL4 346 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TiparpQ8C1B2 657 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppwd1Q8CEC6 646 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 St8sia6Q8K4T1 398 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q8R3Y5 413 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P2ry12Q9CPV9 347 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aldh6a1Q9EQ20 535 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Itga10E9Q6R1 1167 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il20rbE9Q9A6 308 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp2j5O54749 501 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Asna1O54984 348 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 H2-AaP01910 256 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P03976 113 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lbx1P52955 282 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prkg2Q61410 762 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cd34Q64314 382 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Galk2Q68FH4 458 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Frg2f1Q6P3A2 227 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tas2r106Q7M724 308 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf516Q7TSH3 1157 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn1r215Q8R264 300 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ffar2Q8VCK6 330 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Scpep1Q920A5 452 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 D730048I06RikQ9CQB8 106 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cthrc1Q9D1D6 245 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zdhhc21Q9D270 265 aa16.98■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tyw5A2RSX7 315 aa16.97■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TriqkB2B9E1 86 aa16.97■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tacr1P30548 407 aa16.97■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stt3aP46978 705 aa16.97■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnab2P62482 367 aa16.97■□□□□ 0.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ctu2Q3U308 514 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms