RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM1AO60341 852 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB36O95755 333 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRG2P13727 222 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OMPP47874 163 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR18Q14330 331 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAM2Q15035 370 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEBPEQ15744 281 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DESI1Q6ICB0 168 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC190Q86UF4 302 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAX1Q8IWV1 398 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT14Q8NB59 555 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OTULINQ96BN8 352 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGDIGQ99819 225 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAPN10Q9HC96 672 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STARD5Q9NSY2 213 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFB11Q9NX14 153 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STUB1Q9UNE7 303 aa11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNJ13O60928 360 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDRT1O95170 752 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GKN3PP0CG01 181 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UGT2B7P16662 529 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST3GAL3Q11203 375 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFATC4Q14934 902 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAPK14Q16539 360 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA9Q16795 377 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCRL6Q6DN72 434 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BBS1Q8NFJ9 593 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4F15Q8NGB8 312 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM163Q8TC26 289 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM131CQ96AQ9 280 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOAP1Q96BY2 351 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR92Q96MX6 357 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLEC1BQ9P126 229 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR45Q9Y484 360 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42EP2O14613 210 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBXN7O94888 489 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACADMP11310 421 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTNR1AP48039 350 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSSP48449 732 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPTEP56180 551 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP1CAP62136 330 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFRSF17Q02223 184 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN31Q12999 210 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UTS2BQ765I0 119 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR8H2Q8N162 312 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3R3Q92569 461 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NELL2Q99435 816 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAPP1Q9UN19 280 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIPT1Q9Y234 373 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.02□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ISPDA4D126 451 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC72A6NJI9 287 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM183AA6NL82 134 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MU76 341 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYT5O00445 386 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AP3D1O14617 1153 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYL12AP19105 171 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSTM3P21266 225 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAV3P56539 151 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS25P62851 125 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLCNQ8NFG4 579 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFPM2Q8WW38 1151 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLHL3Q9UH77 587 aa11.01□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSR3Q9UNL2 185 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms