RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SNTA1	Q13424	505 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	POU4F3	Q15319	338 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EIPR1	Q53HC9	387 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LUZP2	Q86TE4	346 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	METTL4	Q8N3J2	472 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MARK4	Q96L34	752 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CCL19	Q99731	98 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NUF2	Q9BZD4	464 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CFL2	Q9Y281	166 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		H0Y3Z8	333 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PGRMC2	O15173	223 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AKAP10	O43572	662 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PEX11A	O75192	247 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SEC22B	O75396	215 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CRLF1	O75462	422 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PPM1B	O75688	479 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CHEK2	O96017	543 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	IL3	P08700	152 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NR2F6	P10588	404 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GYS2	P54840	703 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NME5	P56597	212 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FOXF2	Q12947	444 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CUL3	Q13618	768 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR2A2	Q6IF42	318 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AAGAB	Q6PD74	315 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CNPY4	Q8N129	248 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TSSK3	Q96PN8	268 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRMO	Q9BU70	441 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BRF2	Q9HAW0	419 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HEY2	Q9UBP5	337 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ASB4	Q9Y574	426 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AKAP6	Q13023	2319 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PNV4	684 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	C2orf72	A6NCS6	295 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688		C9JVG2	144 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SLC28A1	O00337	649 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	GNB5	O14775	395 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	SNPH	O15079	494 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ACOX3	O15254	700 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	RGS14	O43566	566 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CS-233	ENST00000552688	ICOSLG	O75144	302 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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