RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SDF2Q99470 211 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ITPAQ9BY32 194 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 WDR45Q9Y484 360 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 H3BNH8 94 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PPM1BO75688 479 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 KCNK2O95069 426 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PGM3O95394 542 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 BCHEP06276 602 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 C8BP07358 591 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 THBS1P07996 1170 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 HPGDP15428 266 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ITGA3P26006 1051 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 KDELR2P33947 212 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PTGER1P34995 402 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CASRP41180 1078 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SSR4P51571 173 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 POLE2P56282 527 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 MLF1P58340 268 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 FLOT2Q14254 428 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GLYATQ6IB77 296 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 LCN8Q6JVE9 175 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 PTOV1Q86YD1 416 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 HPS6Q86YV9 775 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 MISPQ8IVT2 679 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 CMIPQ8IY22 773 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 GALNT16Q8N428 558 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TMEM156Q8N614 296 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 BCORP1Q8N888 145 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ASB15Q8WXK1 588 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TM9SF4Q92544 642 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DIO2Q92813 273 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RAB8BQ92930 207 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 FAM162AQ96A26 154 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 TMEM19Q96HH6 336 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 COL21A1Q96P44 957 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 AGAP4Q96P64 663 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.61□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 A8MUI8 341 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 NKX2-8O15522 239 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SUV39H1O43463 412 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ITGA10O75578 1167 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 REM1O75628 298 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 H6PDO95479 791 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 FBXO45P0C2W1 286 aa8.6□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 TBCELQ5QJ74 424 aa8.6□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.6□□□□□ -1.03
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CS-220ENST00000550700 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-220ENST00000550700 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.6□□□□□ -1.03
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