RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 TENM3Q9P273 2699 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.66□□□□□ -1.98
CHMP4A-208ENST00000534106 DSCAMO60469 2012 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1W2PS29 197 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 FRG2CA6NGY1 282 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 LRRC14BA6NHZ5 514 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 WASHC1A8K0Z3 465 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 GOLGA8KD6RF30 607 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 GOLGA8TH3BQL2 631 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 MYO1CO00159 1063 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 NDUFS4O43181 175 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 OR1F1O43749 312 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CEP104O60308 925 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 OR10H2O60403 315 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 RAMP1O60894 148 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 NIPSNAP2O75323 286 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ANXA9O76027 345 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 HAUS5O94927 633 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 GOSR1O95249 250 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CLDN9O95484 217 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ETHE1O95571 254 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 SERPINC1P01008 464 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TGFAP01135 160 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CGAP01215 116 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 HPNP05981 417 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CYC1P08574 325 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC172P0C7W6 258 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 NR2F6P10588 404 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ERGP11308 486 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CDH1P12830 882 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 POU2F1P14859 743 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 PPP3CBP16298 524 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ALOX12P18054 663 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TNNI3P19429 210 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 DDCP20711 480 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TBXA2RP21731 343 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CDKN2BP42772 138 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 KCNJ5P48544 419 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CDK9P50750 372 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 MAP2K6P52564 334 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CLDN15P56746 228 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 FBXW4P57775 412 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 BTN3A2P78410 334 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ABATP80404 500 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CCZ1BP86790 482 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 VLDLRP98155 873 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 RELAQ04206 551 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC13A2Q13183 592 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CUL1Q13616 776 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CYP1B1Q16678 543 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 KLHL38Q2WGJ6 581 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 C3orf36Q3SXR2 165 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TEX35Q5T0J7 233 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 AADACL2Q6P093 401 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CES3Q6UWW8 571 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CYHR1Q6ZMK1 362 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 QSOX2Q6ZRP7 698 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 OVCH2Q7RTZ1 564 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 C9orf40Q8IXQ3 194 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF525Q8N782 197 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 SNX31Q8N9S9 440 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TC2NQ8N9U0 490 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM47BQ8NA70 645 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 MFSD9Q8NBP5 474 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 CAMKVQ8NCB2 501 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 OR4L1Q8NH43 312 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 STYXQ8WUJ0 223 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 ATL1Q8WXF7 558 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 FIG4Q92562 907 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 P3H4Q92791 437 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 PMM1Q92871 262 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 C3orf49Q96BT1 292 aa2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CHMP4A-208ENST00000534106 SGCZQ96LD1 299 aa2.65□□□□□ -1.99
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