RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493315.1

WDPCP-217, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDPCP, Length 1,476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-217ENST00000493315 BNIP3Q12983 259 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 GPR68Q15743 365 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 DCST2Q5T1A1 773 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TSSK4Q6SA08 328 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 LACC1Q8IV20 430 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PARP8Q8N3A8 854 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 GPR151Q8TDV0 419 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 DOK4Q8TEW6 326 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 FKBP10Q96AY3 582 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 NODALQ96S42 347 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 STACQ99469 402 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 UCK2Q9BZX2 261 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 FANCEQ9HB96 536 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RASSF1Q9NS23 344 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.24□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 EYSQ5T1H1 3165 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 A0A1W2PRQ8 180 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 FITM1A5D6W6 292 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 H3BSA7 217 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 FOXS1O43638 330 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 XPNPEP2O43895 674 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PCDHGA12O60330 932 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CTNSO60931 367 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 STX11O75558 287 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 OR2B3O76000 313 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CPNE6O95741 557 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 GASTP01350 101 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 IFNA16P05015 189 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CT62P0C5K7 136 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 KRT20P35900 424 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 GABRA4P48169 554 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CRISP1P54107 249 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 HSD11B2P80365 405 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ZXDAP98168 799 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ST3GAL3Q11203 375 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 MAP4K2Q12851 820 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 BIKQ13323 160 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PMS2P3Q13401 168 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 DGCR6Q14129 220 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 SERTAD2Q14140 314 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RAB39AQ14964 217 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 TRAM2Q15035 370 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 INAVAQ3KP66 663 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RRM2BQ7LG56 351 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 GPR135Q8IZ08 494 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 RIT1Q92963 219 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 SLC38A4Q969I6 547 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 SDF2Q99470 211 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 ARHGDIGQ99819 225 aa7.23□□□□□ -1.25
WDPCP-217ENST00000493315 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms