RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 C3orf18Q9UK00 162 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 OR10H1Q9Y4A9 318 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 AGAP5A6NIR3 686 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0513O60268 411 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 ALOX12BO75342 701 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 MT-CO3P00414 261 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 JMJD7P0C870 316 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 CT45A8P0DMV1 189 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 CT45A9P0DMV2 189 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 IL7RP16871 459 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH3A2P51648 485 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 CT45A2Q5DJT8 189 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 MORN4Q8NDC4 146 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 ZPBPQ9BS86 351 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 WDR54Q9H977 334 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 CRB3Q9BUF7 120 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 KLHL28Q9NXS3 571 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 CYC1P08574 325 aa24.85■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 NNATQ16517 81 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 COMTD1Q86VU5 262 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 TAAR9Q96RI9 348 aa24.85■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 PIGAP37287 484 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 OR1N1Q8NGS0 311 aa24.84■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 PPICP45877 212 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 CDH12P55289 794 aa24.84■■□□□ 1.57
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HOXB3-210ENST00000489475 EIPR1Q53HC9 387 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 LACC1Q8IV20 430 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 DDA1Q9BW61 102 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 USE1Q9NZ43 259 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXB3-210ENST00000489475 PCNX2A6NKB5 2137 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC187A0A096LP49 1063 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-210ENST00000489475 RPSAP08865 295 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-210ENST00000489475 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXB3-210ENST00000489475 GANABQ14697 944 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
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