RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP26	Q9BV47	211 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q9N2J8	555 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	AIG1	Q9NVV5	245 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTM	Q9P121	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DOCK7	Q96N67	2140 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959		E9PLN8	166 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLF11	O14901	512 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDAC3	O15379	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EMC8	O43402	210 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FADS1	O60427	444 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCN2B	O60939	215 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNX4	O95219	450 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL33	O95760	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HPN	P05981	417 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LBP	P18428	481 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GABRA3	P34903	492 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EVI2B	P34910	448 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SOAT1	P35610	550 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT20	P35900	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CASP6	P55212	293 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	UFM1	P61960	85 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	STX5	Q13190	355 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TP53BP2	Q13625	1128 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGS1	Q32NB8	556 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD46	Q86W74	232 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	JADE3	Q92613	823 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDS1	Q92903	461 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LDAH	Q9H6V9	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXO5	Q9H790	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUSD5	O60279	629 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HCN1	O60741	890 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCB7	O75027	752 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAPPC6A	O75865	159 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	UTS2	O95399	124 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPIPA8	P0DM63	369 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CASP9	P55211	416 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP107	P57740	925 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNTA1	Q13424	505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFR3A	Q14156	821 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DECR1	Q16698	335 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDX	Q7Z353	690 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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