RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 AGTR1P30556 359 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 KRT20P35900 424 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PRSS12P56730 875 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CDKL1Q00532 357 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CHRNB3Q05901 458 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SPOCK1Q08629 439 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MED27Q6P2C8 311 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 Q6ZSR9 355 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GGNQ86UU5 652 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 VSTM4Q8IW00 320 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR2M3Q8NG83 312 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR10D3Q8NH80 312 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MUCL1Q96DR8 90 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 HBEGFQ99075 208 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CENPKQ9BS16 269 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF747Q9BV97 191 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PLLPQ9Y342 182 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FKBP7Q9Y680 259 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 STK16O75716 305 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CLDN9O95484 217 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NPIPA8P0DM63 369 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CPMP14384 443 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 DRD5P21918 477 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 IL2RGP31785 369 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CASP2P42575 452 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PPICP45877 212 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF83P51522 516 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GAS1P54826 345 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ITGADQ13349 1161 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EFR3AQ14156 821 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF460Q14592 562 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CCNG2Q16589 344 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PDK4Q16654 411 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ARMC3Q5W041 872 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GALNT10Q86SR1 603 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SVOPLQ8N434 492 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FADS6Q8N9I5 356 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR7G3Q8NG95 312 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 UBE2E3Q969T4 207 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO17Q96EF6 278 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 WDR34Q96EX3 536 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 RADILQ96JH8 1075 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GBP4Q96PP9 640 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TRMOQ9BU70 441 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GLRX2Q9NS18 164 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 STOML1Q9UBI4 398 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 A0A0A6YYD5 115 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TNFSF11O14788 317 aa6.34□□□□□ -1.39
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