RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ESX1Q8N693 406 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC15A4Q8N697 577 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF527Q8NB42 609 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MR1Q95460 341 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TMBIM1Q969X1 311 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF597Q96LX8 424 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PIP5K1AQ99755 562 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CRB3Q9BUF7 120 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SPRY4Q9C004 299 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NTN4Q9HB63 628 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 USE1Q9NZ43 259 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf18Q9UK00 162 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C21orf140B9A014 251 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CDK2AP1O14519 115 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FCMRO60667 390 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FMO6PO60774 539 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ABCB7O75027 752 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NID1P14543 1247 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 UQCRBP14927 111 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SDHBP21912 280 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PEX2P28328 305 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RRM2P31350 389 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SSTR4P31391 388 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KRT20P35900 424 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DCTP40126 519 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ALDH3A2P51648 485 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PNLIPRP2P54317 469 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RAD23AP54725 363 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NRG3P56975 720 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 VLDLRP98155 873 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FUT5Q11128 374 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MED21Q13503 144 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TAF11Q15544 211 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EXT1Q16394 746 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SFT2D3Q587I9 215 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COLEC12Q5KU26 742 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RNF220Q5VTB9 566 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HSDL2Q6YN16 418 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CARM1Q86X55 608 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SMYD1Q8NB12 490 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NUBPLQ8TB37 319 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 M1APQ8TC57 530 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 VMP1Q96GC9 406 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IP6K3Q96PC2 410 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SPSB2Q99619 263 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CIB1Q99828 191 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PSD2Q9BQI7 771 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 V9GYQ6 96 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQ72 361 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FAM149AA5PLN7 773 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 H0YAE9 185 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 H3BNH8 94 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF11BO00300 401 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 AP3D1O14617 1153 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HS6ST1O60243 411 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA0513O60268 411 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZFAND5O76080 213 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 STK17BO94768 372 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms