RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 DYRK2Q92630 601 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RASL10AQ92737 203 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ASB9Q96DX5 294 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HSFY1Q96LI6 401 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TSGA13Q96PP4 275 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DOK1Q99704 481 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 OMDQ99983 421 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SOSTQ9BQB4 213 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 KIFC1Q9BW19 673 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GBA3Q9H227 469 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DPEP3Q9H4B8 488 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RHOJQ9H4E5 214 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SETD4Q9NVD3 440 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MIOSQ9NXC5 875 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RRN3Q9NYV6 651 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ADA2Q9NZK5 511 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HACD3Q9P035 362 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HACL1Q9UJ83 578 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ACOT9Q9Y305 439 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MCM3APO60318 1980 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NEMP2A6NFY4 417 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MSGN1A6NI15 193 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA8TH3BQL2 631 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PIRO00625 290 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NME4O00746 187 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MRASO14807 208 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 UBDO15205 165 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PIP5K1CO60331 668 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATP6V1G1O75348 118 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SUPT3HO75486 399 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SERPINB7O75635 380 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NXPH2O95156 264 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 JCHAINP01591 159 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 VTNP04004 478 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 GNAO1P09471 354 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 IDO1P14902 403 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATP6V1B2P21281 511 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SAT1P21673 171 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RPS12P25398 132 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 DCKP27707 260 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ABCD3P28288 659 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HMOX2P30519 316 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ADRA1AP35348 466 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HALP42357 657 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SLC26A2P50443 739 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATP4BP51164 291 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NME5P56597 212 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TAS2R39P59534 338 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 C1QTNF8P60827 252 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RAB10P61026 200 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MPP1Q00013 466 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RELAQ04206 551 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CDH17Q12864 832 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 RALGDSQ12967 914 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 CBX3Q13185 183 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PMS2P3Q13401 168 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 UBE2V1Q13404 147 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 NFATC2Q13469 925 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 SQLEQ14534 574 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 C16orf72Q14CZ0 275 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MAPRE2Q15555 327 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 TGFBIQ15582 683 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 ATP6AP1Q15904 470 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PSMD5Q16401 504 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 MOGQ16653 247 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRK-202ENST00000368205 HLA-BQ31612 363 aa3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms