RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MED12Q93074 2177 aa7□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 HIVEP1P15822 2718 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WV62 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JNJ9 132 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PIP5K1BO14986 540 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 HDAC3O15379 428 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PDPK1O15530 556 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ICOSLGO75144 302 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 REM1O75628 298 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TGDSO95455 350 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PSMG1O95456 288 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00032P0C843 101 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PRPS2P11908 318 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 GABRA1P14867 456 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SDC1P18827 310 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 HPCAL1P37235 193 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ADH7P40394 386 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PTGDSP41222 190 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KIR3DL1P43629 444 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TFF3Q07654 80 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 EFR3AQ14156 821 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0040Q15053 153 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 GALNTL6Q49A17 601 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TTMPQ5BVD1 217 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 XKR7Q5GH72 579 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 AGR3Q8TD06 166 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TMCO6Q96DC7 493 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35A4Q96G79 324 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 EGLN2Q96KS0 407 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 FCRL1Q96LA6 429 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf26Q96N11 449 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TSSK3Q96PN8 268 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ADOQ96SZ5 270 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SERHLQ9NQF3 203 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MRGBPQ9NV56 204 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ASIC5Q9NY37 505 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 Q9UFV3 132 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 NF1P21359 2839 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 UPK1AO00322 258 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PLOD2O00469 737 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 AKAP10O43572 662 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN2O60636 221 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 TOXO94900 526 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 IFI6P09912 130 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBP2P18065 325 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PRPS1L1P21108 318 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MSX1P28360 303 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ARRB2P32121 409 aa6.98□□□□□ -1.29
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SGMS1-201ENST00000361543 GCKP35557 465 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PNLIPRP2P54317 469 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PSG6Q00889 435 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 OCRLQ01968 901 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 EMX2Q04743 252 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 HSPB3Q12988 150 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PDE7AQ13946 482 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-201ENST00000361543 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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