RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 OSMP13725 252 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 FOLR1P15328 257 aa16.64■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 OR1D4P47884 311 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 EMDP50402 254 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 UGT2B15P54855 530 aa16.64■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 ZAR1Q86SH2 424 aa16.63■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.63■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 MCHR1Q99705 422 aa16.63■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.63■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 CNR2P34972 360 aa16.62■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 SEC14L2O76054 403 aa16.62■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 PGDP52209 483 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 HSD17B7P56937 341 aa16.62■□□□□ 0.25
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ACTB-201ENST00000331789 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 ILKQ13418 452 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 HLA-BQ31612 363 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 P3H2Q8IVL5 708 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 OR4N2Q8NGD1 307 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 MPP4Q96JB8 637 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.62■□□□□ 0.25
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