RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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HOXD8-201ENST00000313173 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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HOXD8-201ENST00000313173 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXD8-201ENST00000313173 POLE3Q9NRF9 147 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXD8-201ENST00000313173 PRR14Q9BWN1 585 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC90BQ9GZT6 254 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD19PQ9H560 264 aa24.94■■□□□ 1.58
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HOXD8-201ENST00000313173 CCDC103Q8IW40 242 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXD8-201ENST00000313173 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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HOXD8-201ENST00000313173 MSL3P1P0C860 447 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXD8-201ENST00000313173 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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