RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR6C6A6NF89 314 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TNFRSF10BO14763 440 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 IFNA1P01562 189 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ACTR1BP42025 376 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PDX1P52945 283 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ACTR1AP61163 376 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 HMGB4Q8WW32 186 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CNIH4Q9P003 139 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 C12orf40Q86WS4 652 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 APIPQ96GX9 242 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 OR2M2Q96R28 347 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PPL8 197 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RAB4AP20338 218 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PBX2P40425 430 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SP3Q02447 781 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 A6NIN4 97 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ACOT7O00154 380 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PRAF2O60831 178 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ASGR2P07307 311 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 UPP1Q16831 310 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 GPAT4Q86UL3 456 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FRZBQ92765 325 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SAMD8Q96LT4 415 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CTDSP2O14595 271 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PFKLP17858 780 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ERVFC1P60507 584 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.864e-9■■■■■ 42.6
TTL-201ENST00000233336 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 YIPF1Q9Y548 306 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 HOXC12P31275 282 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CPOQ8IVL8 374 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SEC14L2O76054 403 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MAVSQ7Z434 540 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RDH14Q9HBH5 336 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 COPS3Q9UNS2 423 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 E2F3O00716 465 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 UGT2B7P16662 529 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CD53P19397 219 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PRSS3P35030 304 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CLRN1P58418 232 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CEP68Q76N32 757 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 IL12RB2Q99665 862 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 THSD1Q9NS62 852 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NME7Q9Y5B8 376 aa9.67□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PQY0 241 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MGAT3Q09327 533 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SPRED1Q7Z699 444 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 AHSA1O95433 338 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ADH5P11766 374 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SMARCD2Q92925 531 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 TXNDC15Q96J42 360 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 LMF1Q96S06 567 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 RASD1Q9Y272 281 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 NCR1O76036 304 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CD3GP09693 182 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 PKLRP30613 574 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 SLC26A5P58743 744 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DPF3Q92784 378 aa9.66□□□□□ -0.86
TTL-201ENST00000233336 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms