RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 C22orf42Q6IC83 251 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 OR2L13Q8N349 312 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 RFKQ969G6 155 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM203Q969S6 136 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SMIM10Q96HG1 83 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 KCTD7Q96MP8 289 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 MYADMQ96S97 322 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CERS4Q9HA82 394 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa16.2■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SURF4O15260 269 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SSX4O60224 188 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 APOL3O95236 402 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CARTPTQ16568 116 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM196Q5HYL7 178 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PARM1Q6UWI2 310 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 HSDL2Q6YN16 418 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 MCHR1Q99705 422 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PHF11Q9UIL8 331 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 POM121BA6NF01 834 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC30A4O14863 429 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 NTSR1P30989 418 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 HOXC5Q00444 222 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 MXD1Q05195 221 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 BAK1Q16611 211 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 ZMAT1Q5H9K5 638 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 AGAP6Q5VW22 663 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 UFD1Q92890 307 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 FGF14Q92915 247 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 AGAP4Q96P64 663 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 OR2A5Q96R48 311 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TEX12Q9BXU0 123 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.19■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TNFSF14O43557 240 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 NARSO43776 548 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 GNSP15586 552 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CPN2P22792 545 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 GABRA5P31644 462 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CDH11P55287 796 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PPP2CBP62714 309 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 PPP2CAP67775 309 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SPATC1Q76KD6 591 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 OR4K14Q8NGD5 310 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CDS1Q92903 461 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SERINC2Q96SA4 455 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 FBRSQ9HAH7 460 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 ABCB9Q9NP78 766 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 GAAP10253 952 aa16.17■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SDC2P34741 201 aa16.17■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SLC1A3P43003 542 aa16.17■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 KIR2DS3Q14952 304 aa16.17■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 USP53Q70EK8 1073 aa16.17■□□□□ 0.18
CLDN11-201ENST00000064724 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms