RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HemgnQ9ERZ0 503 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 C1qtnf3Q9ES30 246 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ing2Q9ESK4 281 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rcan2Q9JHG2 197 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nrip2Q9JHR9 270 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il20Q9JKV9 176 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crlf1Q9JM58 425 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PtgfrnQ9WV91 879 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GghQ9Z0L8 317 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aldh18a1Q9Z110 795 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BsnO88737 3942 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa4.99□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1160A2AVT0 319 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A630010A05RikA9C473 232 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B1ARW8 110 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gabrr3B2RXA8 464 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr652B9EHE6 318 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akap5D3YVF0 745 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6619F6URP1 175 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcng2F7A6P6 480 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr292F8VQ84 308 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r85G3UW56 850 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r39G3UWE6 305 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm43302L7N1X8 611 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r46L7N282 809 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r29L7N2D4 852 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dscr3O35075 297 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gstm6O35660 218 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ChkaO54804 453 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ptpn20O55082 426 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psmb5O55234 264 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Top3aO70157 1003 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01641 117 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd2P08920 344 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd3gP11942 182 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scd1P13516 355 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BrafP28028 804 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnfsf10P50592 291 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dynlt1P51807 113 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CcnfP51944 777 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab1AP62821 205 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tuba4aP68368 448 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Reg2Q08731 173 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defb20Q30KP3 96 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q32M26 199 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fcho2Q3UQN2 809 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wfdc6aQ3UW55 136 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zmat1Q3V0C1 714 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim67Q505D9 768 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kctd19Q562E2 927 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr65Q61038 337 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lefty1Q64280 368 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sort1Q6PHU5 825 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp759Q7M6X3 721 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Far2Q7TNT2 515 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ZfatQ7TS63 1237 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ckap2lQ7TS74 745 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BtlaQ7TSA3 306 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpp38Q80UU2 280 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhdc1Q80YG3 406 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abhd16bQ80YU0 474 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc36a3Q811P0 477 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P4htmQ8BG58 503 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DglucyQ8BH86 617 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itih5Q8BJD1 952 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hspa13Q8BM72 471 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc18a2Q8BRU6 517 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TbcdQ8BYA0 1196 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rdh12Q8BYK4 316 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5111Q8C9M4 190 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc46a2Q8CA03 479 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxw17Q8CFE8 466 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nudt13Q8JZU0 352 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 St8sia6Q8K4T1 398 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smyd2Q8R5A0 433 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1330Q8VEY6 315 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr672Q8VG28 312 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf24Q91VN1 368 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbms1Q91W59 403 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crtc3Q91X84 619 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TfQ921I1 697 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab28Q99KL7 221 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prl8a9Q9CQ58 241 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Exosc5Q9CRA8 235 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam162bQ9CX19 157 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem178aQ9CZ16 297 aa4.98□□□□□ -1.61
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Neurl2Q9D0S4 285 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.1 ms