RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	SP140L	Q9H930	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PDHX	O00330	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TYROBP	O43914	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MTX2	O75431	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TM7SF2	O76062	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OPN1LW	P04000	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UGT2B4	P06133	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HCK	P08631	526 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NT5E	P21589	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PPT1	P50897	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PRELP	P51888	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OSTN	P61366	133 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CBX1	P83916	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MLX	Q9UH92	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	CXCL11	O14625	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	PALM	O75781	387 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	NUDT14	O95848	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	CPN1	P15169	458 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	SLC1A4	P43007	532 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	POU3F4	P49335	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	RIPK1	Q13546	671 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	CAMK4	Q16566	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	PARG	Q86W56	976 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	WBP1	Q96G27	269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	MET	P08581	1390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	CASK	O14936	926 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	GPRIN2	O60269	458 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	SNX4	O95219	450 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ADCY5	O95622	1261 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ATP4B	P51164	291 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	GSTO1	P78417	241 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	HYAL1	Q12794	435 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	RAB35	Q15286	201 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	PCK2	Q16822	640 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PVT1-225	ENST00000617087	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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