RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 METAP1P53582 386 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 NUCB2P80303 420 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CD300CQ08708 224 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TFDP1Q14186 410 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RAB35Q15286 201 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ERICH1Q86X53 443 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TESK2Q96S53 571 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PALMDQ9NP74 551 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN5O00501 218 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TBX19O60806 448 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA1P02708 482 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA5P28066 241 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 IFNAR2P48551 515 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGDIAP52565 204 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TATDN3Q17R31 274 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 NADK2Q4G0N4 442 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf177Q52M58 125 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PNCKQ6P2M8 343 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 UPRTQ96BW1 309 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TXN2Q99757 166 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 VGLL1Q99990 258 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SENP1Q9P0U3 644 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 GALPQ9UBC7 116 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SNX6Q9UNH7 406 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 A8MUI8 341 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 DLSTP36957 453 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 BRCC3P46736 316 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ACADVLP49748 655 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 USH1GQ495M9 461 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N377 158 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RNF24Q9Y225 148 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 CASKO14936 926 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RAMP1O60894 148 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 OTX2P32243 289 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 FCN2Q15485 313 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2V2Q15819 145 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ZIC1Q15915 447 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 IPMKQ8NFU5 416 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3CQ96E17 227 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 RMND5AQ9H871 391 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GSAPA4D1B5 854 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TM9SF1O15321 606 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GMFGO60234 142 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3O95983 291 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF883P0CG24 379 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DRD5P21918 477 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC8Q8TC99 324 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RASL10AQ92737 203 aa6.14□□□□□ -1.43
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