RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487720.1

SKAP2-205, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-205ENST00000487720 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.52□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.52□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.52□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.52□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SMIM23A6NLE4 172 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 UPK1AO00322 258 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 ZIC3O60481 467 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CRCPO75575 148 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 IFI6P09912 130 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 BMP5P22003 454 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TACR1P25103 407 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 Q6ZSR9 355 aa9.51□□□□□ -0.89
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SKAP2-205ENST00000487720 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CDH24Q86UP0 819 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 OR2L13Q8N349 312 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 ELP4Q96EB1 424 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 EGLN2Q96KS0 407 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 UCN2Q96RP3 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 WIF1Q9Y5W5 379 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.51□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 FAM221AA4D161 298 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SLC28A1O00337 649 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 DVL2O14641 736 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 AZIN1O14977 448 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TRIM13O60858 407 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 COQ9O75208 318 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SEC22BO75396 215 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CTAG2O75638 210 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 IL18BPO95998 194 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 IL2RAP01589 272 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 FGF4P08620 206 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 NUDT17P0C025 328 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CYP4B1P13584 511 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 GRK2P25098 689 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CTSSP25774 331 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 IL12BP29460 328 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SRD5A2P31213 254 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 GCKP35557 465 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 KRT20P35900 424 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 PEX19P40855 299 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MC3RP41968 323 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 KIR2DL3P43628 341 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 LHX2P50458 406 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 ASCL1P50553 236 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MYBPHQ13203 477 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 GAB1Q13480 694 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 PCLAFQ15004 111 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TMEM107Q6UX40 140 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 FADS6Q8N9I5 356 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 BANPQ8N9N5 519 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CCDC63Q8NA47 563 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 OR2T11Q8NH01 316 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 OR14L1PQ8NHC6 308 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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SKAP2-205ENST00000487720 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SKAP2-205ENST00000487720 TRIB1Q96RU8 372 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TRMOQ9BU70 441 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 C1orf109Q9NX04 203 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MKS1Q9NXB0 559 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 JKAMPQ9P055 326 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 SENP1Q9P0U3 644 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.5□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 MPDZO75970 2070 aa9.49□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 AKAP6Q13023 2319 aa9.49□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 DOCK7Q96N67 2140 aa9.49□□□□□ -0.89
SKAP2-205ENST00000487720 TLDC2A0PJX2 215 aa9.49□□□□□ -0.89
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