RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 PIGUQ9H490 435 aa14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 CFL2Q9Y281 166 aa14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.96□□□□□ -0.01
UBE2E1-209ENST00000484048 TTC36A6NLP5 189 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 DUXAA6NLW8 204 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 NKX2-2O95096 273 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ITGB2P05107 769 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ALOX5P09917 674 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 PSG6Q00889 435 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 RBBP4Q09028 425 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 BNIP2Q12982 314 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CLN3Q13286 438 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MYBPC3Q14896 1274 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 DUSP5Q16690 384 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 VMACQ2NL98 169 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 RAB43Q86YS6 212 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 AMER2Q8N7J2 671 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC9A6Q92581 669 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 JADE3Q92613 823 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 EXTL1Q92935 676 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MAL2Q969L2 176 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ASB9Q96DX5 294 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC35A4Q96G79 324 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ITPAQ9BY32 194 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 POMPQ9Y244 141 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 RELNP78509 3460 aa14.95□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ACOT8O14734 319 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SOX30O94993 753 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 AGR2O95994 175 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 HPP00738 406 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM87AP0C7U9 286 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 PCGF2P35227 344 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MS4A2Q01362 244 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 FUT5Q11128 374 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 VEZF1Q14119 521 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MAPK11Q15759 364 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 EXT1Q16394 746 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MRGPREQ86SM8 312 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 VASH2Q86V25 355 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 OR8K3Q8NH51 312 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CDS1Q92903 461 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 VPS50Q96JG6 964 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 BTBD9Q96Q07 612 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MUC13Q9H3R2 512 aa14.94□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ARPC2O15144 300 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 TFPTP0C1Z6 253 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CT45A8P0DMV1 189 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CT45A9P0DMV2 189 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 GGT1P19440 569 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SOX11P35716 441 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 PPICP45877 212 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CLCN2P51788 898 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CORO7P57737 925 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 DCAF7P61962 342 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 RNF4P78317 190 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CDK6Q00534 326 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SCARB2Q14108 478 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 BTBD16Q32M84 506 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM13CQ8NE31 585 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 M1APQ8TC57 530 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 ELP5Q8TE02 316 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 IP6K3Q96PC2 410 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 MMP25Q9NPA2 562 aa14.93□□□□□ -0.02
UBE2E1-209ENST00000484048 EXD2Q9NVH0 621 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms