RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 EQTNQ9NQ60 294 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 QPCTLQ9NXS2 382 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CBLCQ9ULV8 474 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MAPRE3Q9UPY8 281 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 HECTD1Q9ULT8 2610 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8OA6NCC3 632 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 C2orf72A6NCS6 295 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF25A6NGN4 478 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TTC36A6NLP5 189 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8NF8WBI6 632 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNF195O14628 629 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 NKX2-2O95096 273 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 C6orf47O95873 294 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CYP4B1P13584 511 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GABRA3P34903 492 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 KRT20P35900 424 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PER3P56645 1201 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 EFR3AQ14156 821 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TIGD3Q6B0B8 471 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MAVSQ7Z434 540 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 RNF138Q8WVD3 245 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GNRHR2Q96P88 292 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MS4A4EQ96PG1 132 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PHF12Q96QT6 1004 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL11Q9BXB4 747 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 DPY30Q9C005 99 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 UBQLN3Q9H347 655 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CXorf36Q9H7Y0 433 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 KLRF1Q9NZS2 232 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 HRH3Q9Y5N1 445 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC13O75165 2243 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ICE1Q9Y2F5 2266 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GXYLT2A0PJZ3 443 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PRRG2O14669 202 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GNB5O14775 395 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ZG16O60844 167 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ACP2P11117 423 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 IL12BP29460 328 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MASP1P48740 699 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 WNT3P56703 355 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R2AP63151 447 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PGS1Q32NB8 556 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 OR4F3Q6IEY1 312 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MFSD12Q6NUT3 480 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CDRT4Q8N9R6 151 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 C16orf58Q96GQ5 468 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CCDC120Q96HB5 630 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 C7orf26Q96N11 449 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ACKR4Q9NPB9 350 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 AIG1Q9NVV5 245 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 B4GALT7Q9UBV7 327 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 C15orf41Q9Y2V0 281 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 NPIPA2E9PIF3 369 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 NPIPA3F8WFD2 350 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ADAM10O14672 748 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SNPHO15079 494 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SUSD5O60279 629 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 HCN1O60741 890 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SCN2BO60939 215 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 IL33O95760 270 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TPOP07202 933 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PTPN6P29350 595 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PRR5P85299 388 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 DECR1Q16698 335 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 VPS26BQ4G0F5 336 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 EMC4Q5J8M3 183 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SZRD1Q7Z422 152 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SPATA19Q7Z5L4 167 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CD163Q86VB7 1156 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 WDSUB1Q8N9V3 476 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OR8J2Q8NGG1 315 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 LRRC8CQ8TDW0 803 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PIK3R3Q92569 461 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 LDAHQ9H6V9 325 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MEMO1Q9Y316 297 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 AQP7O14520 342 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-16P01601 117 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 HPNP05981 417 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GDF1P27539 372 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CCT3P49368 545 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MAN2A2P49641 1150 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GAS1P54826 345 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 HBA1P69905 142 aa19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms