RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 COL21A1Q96P44 957 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 OSBPL11Q9BXB4 747 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 UBQLN3Q9H347 655 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 METTL7AQ9H8H3 244 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GALNT9Q9HCQ5 603 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EQTNQ9NQ60 294 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12.89□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PRR14LQ5THK1 2151 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PRAMEF25A6NGN4 478 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CCL21O00585 134 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 HDAC3O15379 428 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ABCB7O75027 752 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 REM1O75628 298 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SNX4O95219 450 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 KITP10721 976 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 LBPP18428 481 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 IL12BP29460 328 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PTGS2P35354 604 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 MASP1P48740 699 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PNLIPRP2P54317 469 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PER3P56645 1201 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TRILQ7L0X0 811 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SZRD1Q7Z422 152 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 MAVSQ7Z434 540 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CD163Q86VB7 1156 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 FAM57AQ8TBR7 257 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CCDC120Q96HB5 630 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ADOQ96SZ5 270 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 DUSP26Q9BV47 211 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ATAD3AQ9NVI7 634 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 KLRF1Q9NZS2 232 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 B4GALT7Q9UBV7 327 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 C15orf41Q9Y2V0 281 aa12.88□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ABCA4P78363 2273 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 A0A1B0GVC2 190 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 A0A1W2PRB8 838 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TRPC5OSA6NMA1 111 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PRRG2O14669 202 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ADAM10O14672 748 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SNPHO15079 494 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EMC8O43402 210 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ICOSLGO75144 302 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 C6orf47O95873 294 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TPOP07202 933 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ACP2P11117 423 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GDF1P27539 372 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EPHA3P29320 983 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 KRT20P35900 424 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CASP6P55212 293 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SNTA1Q13424 505 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CYP27C1Q4G0S4 372 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EMC4Q5J8M3 183 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TMEM198Q66K66 360 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 MFSD12Q6NUT3 480 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PAOXQ6QHF9 649 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PACS2Q86VP3 889 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 DOLPP1Q86YN1 238 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 NUP43Q8NFH3 380 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 FBXO30Q8TB52 745 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PHF12Q96QT6 1004 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SLC6A15Q9H2J7 730 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CXorf36Q9H7Y0 433 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 C3orf14Q9HBI5 128 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 Q9N2J8 555 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 AIG1Q9NVV5 245 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 QPCTLQ9NXS2 382 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CBLCQ9ULV8 474 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 MAPRE3Q9UPY8 281 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 WIF1Q9Y5W5 379 aa12.87□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TEX15Q9BXT5 2789 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GXYLT2A0PJZ3 443 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 A1L4Q6 167 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA8OA6NCC3 632 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 OR14I1A6ND48 311 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 B4DXG7 233 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA8NF8WBI6 632 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 AQP7O14520 342 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ZNF195O14628 629 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GNB5O14775 395 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SUSD5O60279 629 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 NKX2-2O95096 273 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CLDN1O95832 211 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 CYP4B1P13584 511 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PTPN6P29350 595 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 EVI2BP34910 448 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms