RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MYOGP15173 224 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NCK1P16333 377 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MARK3P27448 753 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 HPCAL1P37235 193 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SYKP43405 635 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CASP4P49662 377 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 IFT88Q13099 833 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.18□□□□□ -1.58
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RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 POC1AQ8NBT0 407 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPK15Q8TD08 544 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX13Q92968 403 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CD101Q93033 1021 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF479Q96JC4 524 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DHRS7Q9Y394 339 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 STK36Q9NRP7 1315 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GVL5 298 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PNV4 684 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF195O14628 629 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 INPP4BO15327 924 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB6O75190 326 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 STAG3L3P0CL85 134 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 POU2F1P14859 743 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 BRCC3P46736 316 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 AP3M2P53677 418 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX3P56589 373 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC6Q16204 474 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DPYSL2Q16555 572 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC50Q53HI1 259 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC66Q68CR7 880 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGGTB-209ENST00000473406 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGGTB-209ENST00000473406 HACD2Q6Y1H2 254 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.582e-9■■■□□ 17
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RABGGTB-209ENST00000473406 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6S1Q8NH40 331 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR174Q9BXC1 333 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF724A8MTY0 619 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7A17O14581 309 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF12O43508 249 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF13O43567 381 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PGK1P00558 417 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT14P02533 472 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SLPIP03973 132 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NGFRP08138 427 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 HSMCR30P0CW71 290 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PGCP20142 388 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2B6P20813 491 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 EDNRAP25101 427 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PAX9P55771 341 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NTHL1P78549 312 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2V2Q15819 145 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SCYL2Q6P3W7 929 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 GCNT7Q6ZNI0 430 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.16□□□□□ -1.58
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