RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 KCTD7Q96MP8 289 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ARHGDIGQ99819 225 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IGFLR1Q9H665 355 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CHST2Q9Y4C5 530 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
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ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SYT5O00445 386 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 BTN3A3O00478 584 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IL1AP01583 271 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CD79BP40259 229 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GPR4P46093 362 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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ACTB-207ENST00000462494 SYT14Q8NB59 555 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 LCN9Q8WX39 176 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 DIO2Q92813 273 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 UFD1Q92890 307 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ZNF681Q96N22 645 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 APOOQ9BUR5 198 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SIAEQ9HAT2 523 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 OBP2AQ9NY56 170 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 AP3D1O14617 1153 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC30A4O14863 429 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IL7P13232 177 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TEAD1P28347 426 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 OMPP47874 163 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PLK5Q496M5 336 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 AGAP6Q5VW22 663 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NRROSQ86YC3 692 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC35A4Q96G79 324 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 AGAP4Q96P64 663 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SRRQ9GZT4 340 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RMI1Q9H9A7 625 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CALML5Q9NZT1 146 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 LIPT1Q9Y234 373 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TRANK1O15050 2925 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 IRGMA1A4Y4 181 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 AGRPO00253 132 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 HOXD12P35452 270 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CDH11P55287 796 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 CAV3P56539 151 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 WDFY2Q96P53 400 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 MCHR1Q99705 422 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FGF22Q9HCT0 170 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SNX7Q9UNH6 387 aa15.86■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.86■□□□□ 0.13
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ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PQ09 198 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 TMEM129A0AVI4 362 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 FABP12A6NFH5 140 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 STK25O00506 426 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 EML2O95834 649 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GSTT2P0CG29 244 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GSTT2BP0CG30 244 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 GDI1P31150 447 aa15.85■□□□□ 0.13
ACTB-207ENST00000462494 SOX18P35713 384 aa15.85■□□□□ 0.13
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