RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 RMND5AQ9H871 391 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM45AQ9NWC5 275 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 GIN1Q9NXP7 522 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 NBASA2RRP1 2371 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TSPAN2O60636 221 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 CBX6O95503 412 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 UQCRC2P22695 453 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 MAP3K8P41279 467 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 CASP3P42574 277 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SNTA1Q13424 505 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM81Q6P7N7 255 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SLC16A11Q8NCK7 471 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 HGDQ93099 445 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 C16orf58Q96GQ5 468 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 STACQ99469 402 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ANGPTL4Q9BY76 406 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 IL1RL2Q9HB29 575 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 DUSP22Q9NRW4 184 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0G2JMM0 328 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PPB8 328 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PRS3 328 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ANKUB1A6NFN9 424 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 KIR3DP1A8MWS1 328 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 WISP1O95388 367 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 MST1P26927 711 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RFC3P40938 356 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ATP4BP51164 291 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SQLEQ14534 574 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 METTL21CQ5VZV1 264 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 CDC73Q6P1J9 531 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 C6orf120Q7Z4R8 191 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 COX18Q8N8Q8 333 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 OR9I1Q8NGQ6 314 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ADAMTS15Q8TE58 950 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 YIPF4Q9BSR8 244 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TTTY12Q9BZ98 90 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 GPATCH2Q9NW75 528 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 KLRF1Q9NZS2 232 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SEC14L3Q9UDX4 400 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 NPIPA5E9PKD4 350 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 KCNK10P57789 538 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PPIAP62937 165 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 DUSP5Q16690 384 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SLC30A6Q6NXT4 461 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO30Q8TB52 745 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PIK3R3Q92569 461 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PIGUQ9H490 435 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ZFP64Q9NPA5 681 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 NPIPA1Q9UND3 350 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PINLYPA6NC86 204 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 DUXAA6NLW8 204 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 IL33O95760 270 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ACP2P11117 423 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RFX3P48380 749 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 MASP1P48740 699 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TDGF1P3P51864 188 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 FOXO1Q12778 655 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF597Q96LX8 424 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 GPR137Q96N19 417 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 NODALQ96S42 347 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PROK2Q9HC23 129 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 MRGBPQ9NV56 204 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 B4GALT7Q9UBV7 327 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF25A6NGN4 478 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC154A6NI56 674 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RFXANKO14593 260 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ASNA1O43681 348 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 GLSO94925 669 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ARFIP2P53365 341 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 HYAL4Q2M3T9 481 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 TIGD2Q4W5G0 525 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 RNFT1Q5M7Z0 435 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 BICRALQ6AI39 1079 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 GFRALQ6UXV0 394 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF621Q6ZSS3 439 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SIAH3Q8IW03 269 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 ITCHQ96J02 903 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 SLC35A5Q9BS91 424 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 G6PC3Q9BUM1 346 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 BTBD2Q9BX70 525 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 OSBPL11Q9BXB4 747 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC167Q9P0B6 97 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms